Decyzję o rekuperacji najlepiej podjąć na etapie adaptacji projektu budowlanego. Pozwala to zrezygnować z budowy drogich kominów do wentylacji grawitacyjnej, co daje realne oszczędności finansowe (często pokrywające znaczną część kosztów samego rekuperatora). Fizyczny montaż instalacji (kanałów rozprowadzających) wykonuje się najczęściej w stanie surowym zamkniętym, przed wykonaniem wylewek (kanały płaskie na chudziaku) oraz przed tynkami i podwieszeniem sufitów. Montaż rekuperatora (centrali) oraz anemostatów następuje na samym końcu budowy. Instalacja w domach zamieszkanych jest możliwa, zazwyczaj z wykorzystaniem nieużytkowego poddasza do poprowadzenia głównych kanałów i ukrywania rur w zabudowach z płyt g-k.